ספר משפטי שמואל שהוא ביאור על משניות סדר “זרעים”, נדפס לראשונה ע”י צוות רבני המכון מכתב ידו של המחבר, הגאון רבי שמואל בן רבי אברהם הרופא הכהן זצוק”ל, מגדולי חכמי פאס במרוקו מלפני 400 שנה.
הספר הינו נדיר ומיוחד במינו, של חד ומיוחד מרבני מרוקו הקדמוניים הגאון רבי שמואל הכהן זצוק”ל, שכתב סביב המשניות סדר זרעים. עבודתו התייחדה בביאורים סביב מפרשי המשנה, רבנו הרמב”ם ורבינו הר”ש. עליהם הרחיב את ביאורו ועליהם הוא צייר עשרות ציורים מורכבים, כאשר לפניו היה דפוס ונציא בלבד שלא כלל ציורים כידוע. בנוסף, כדי להקל על התלמידים מפעל לפעם כאשר החומר מתארך הוא שב ועושה קיצורים עבורם. בנוסף לפירושו סביב משניות זרעים, טרח וביאר את התוספתא של “אנדרוגינוס” שהסתפחה כפ”ד במסכת ביכורים, ויצר לה ביאור ופירוש, האחד ארוך והאחד קצר.
את כל זה זכינו ב”ה להוציא לאור לאחר שנים של עבודה מיוחדת ומושקעת מאד.
הספר הזה עבר כמה גלגולים במכון עד שזכינו להוציאו לאור. ראשיתו לפני כעשור ומחצה עת קיבלנו את כתב היד מהרה”ג רבי משה עמאר, ראש מכון אורות יהדות המגרב. בהמשך, הרב יצחק לוי שהיה מחוקרי המכון דאז, החל לפענח את הכת”י ולא השלמנו את העבודה. ב”ה החל משנת 2009 עבדנו באינטנסיביות על הספר וביתר שאת בשנת 2010, כאשר העבודה כללה פיענוח מלא של הכת”י. חיפוש אחר המקור להשלמת החסר כגון הקדמת המחבר וב”ה זה נמצא והודפס בראש הספר, וכן ההסכמות שקיבל מחכמי דורו, הערות והארות על דברי המחבר, השוואת נוסחאות שונות של הדפסת המשנה [ונציה, נפולי, וילנא ועוד], איורים מחדש בחברת גרפיקה של כל הציורים מחדש, כתיבת מבוא ארוך על המחבר, חייו ותקופתו, שערך עבורנו הרה”ג רבי משה עמאר, ראש מכון אורות יהדות המגרב. ועוד כהנה וכהנה כפי שיחזה המעיין. האחראי הראשי שעמד בראש הצוות הוא, הרב אליהו ראש שליט”א ועמו יו”ר המכון הרב שניאור ז. רווח שליט”א, והרב מאיר שטורך שליט”א.